水源热泵空调系统节能的主要原因，利用废气、废热等低品质循环水作为冬季供暖的补充热源，当建筑物内有多余的热量或同一时间内部分区域需要制冷、部分区域需要制热时，部分热泵机组处于制冷工作状态，向循环水让热，另一部分机组处于制热工作状态，从循环水中夏侯热量，这样，建筑物内冷热负荷可以在内部消化掉一部分，从而达到节能的目的，冬季使用时，即使有辅助热源加热的问题，但该热源只是提供10%~30%的热负荷热量，主要的热负荷由一部分制冷方式运行的机组回收冷凝热来抵消或采用其他的预热、废热来解决。
水源热泵空调系统的节能性还表现在部分负荷的节能上，水源热泵空调系统是由单个的水源热泵组成，且分散在各个房间，在部分负荷时只有所需房间的热泵机组和循环水运行，因此能耗可大大降低，对于空调建筑，全年有75%的时间系统运行负荷不到设计负荷的一半，仅有5%的时间在设计负荷下运行，传统的制冷、制热、循环水系统长期在低效率下工作，能耗损失大，而水源热泵空调系统则可视使用情况决定开机多少，达到节能效果。
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