离心机保持斗的平衡，如管上标有数字，则按如下放置：管1对着管2；管3对着管4。相互对面放着2个管，应放在斗中，并先在天平上秤一下，以保持两者重量平衡，可以给较轻的管多加些准备离心的液体，或者给装有较轻管子的斗中加水，如果只有1个管内的液体准备离心，则用另一相同的管，其中装水以使两管平衡。
离心机仪器通常有橡皮垫子，垫着斗的底部，这样，可保护离心管的管底。用一洗瓶，加水量水于每个管与其斗之间。
离心机开动马达并逐渐加快速度，慢慢转动旋钮，直至达到预期的速度为止。逐渐使离心机停止。缓慢而小心地取出试管。在离心机未完全停止之前，绝不能打开离心机。不要用手使离心机减速。
离心机的机壳要保持十分洁净。斗子用后要冲洗，冲掉任何血迹等。应该由专家依据厂商的说明来进行润滑。
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