离心机离心后离心管中各分离物质一般用三种方法进行分部收集，即虹吸法、取代法及底部穿刺法。
离心机虹吸法不需损伤离心管，尤其适用于不锈钢离心管中物质的分部收集，因为虹吸时要严防已分离物被扰动，需要专用的虹吸装置。
取代法是在离心管的底部穿刺，把一种很稠密的介质慢慢地注入离心管底部，以使梯度溶液从上面被顶出来，然后用注射器或移液管逐一移出个部分，或在离心管颈部加一个塞子，塞子经一根导管通向分部收集器来进行分部收集。
离心机穿刺法是从离心管底部穿刺，使梯度自由流出。为此可制作一种简单的固定器，其底部装一个垂直向上的针头，这样，当装入离心管时，其底部正好被刺穿，1~2s钟后，开始缓慢地流出第一滴，从而可以从容地进行分部收集。
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