离心机管套底部应点上柔软物质如棉花、橡皮垫或泡沫塑料等，以防旋转时离心管被碰破。
离心管放入离心机的管套中时，管口应稍高于管套，离心管应放入对称的管套中且质量应相近。如果只有一支离心管中的溶液需处理，则应取一支装有等量水的离心管放入其对称位置，目的是保持离心机的平衡，避免转动时发生震动，损坏离心机。
启动离心机时应由慢速开始，待运转平稳后再开到快速，离心机启动后如发生振动或怪声，应立即关机，检查原因。
转速与旋转时间由被测物质的沉淀性状决定。晶形沉淀转速以1000r/min，离心1~2min为宜；非晶形沉淀沉降比较慢，转速可提到2000r/min，离心3~4min。
关机后，应待离心机转动自行停止，不得用手阻止其旋转，不得用手指插入离心管中拔取离心管，应捏住离心管口边缘将其取出或用镊子夹取。
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