在使用实验室离心机时，仪器良好的机械性能是保障微生物安全的前提条件。应该按照操作手册来操作离心机。
离心机放置的高度应当使小个子工作员也能够看到离心机内部，以正确放置十字轴和离心桶。离心管和盛放离心标本的容器应当由厚壁玻璃制成，或最好为塑料制品，并且在使用钱应检查是否破损，用于离心的试管和标本容器应当适中牢固盖紧，离心桶的装载、平衡、密封和打开必须在生物安全柜内进行，离心桶和十字轴应按重量配对，并在装在离心管后正确平衡。操作指南中应给出液面距离心管管口需要留出的空间大小。空离心桶应当用蒸馏水或乙醇来平衡盐溶液或次氯酸盐溶液对金属具有腐蚀作用，因此不能使用。对于危险度3级和4级的微生物，必须使用封口的离心轴，应当每天检查离心机内转子部位的腔壁是否被污染或弄脏。
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